T-COFFEE, Version_11.00 (Version_11.00)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=520
*
 BAD AVG GOOD
*
TNFR10-2_2    :  55
TNFR10-3_2    :  57
TNFR1-1_1     :  54
TNFR1-2_2     :  56
TNFR1-3_2     :  55
TNFR1-4_2     :  41
TNFR14-1_1    :  55
TNFR14-2_2    :  56
TNFR13C-1_3   :  45
TNFR16-1_1    :  52
TNFR16-2_2    :  53
TNFR16-3_2    :  58
TNFR16-4_2    :  59
TNFR13B-2_3   :  37
TNFR17-1_3    :  46
TNFR4-1_1     :  54
TNFR4-2_2     :  57
TNFR4-4_2     :  57
TNFR12-1_3    :  44
TNFR2-1_1     :  57
TNFR2-2_2     :  58
TNFR2-3_2     :  54
TNFR2-4_2     :  54
cons          :  52

TNFR10-2_2    CKYG--Q-DYSTHWN-DLLFCLRCT---R-CDS--GEVELSPCT-TTRNTVC
TNFR10-3_2    CEEG--T-FR-EED--SPEMCRKCR--TG-CPR--GMVKVGDCT-PWSDIEC
TNFR1-1_1     CPQG--K-YI-HPQN--N--SICCT---K-CHK--GTYLYNDCPGPGQDTDC
TNFR1-2_2     CESG--S-FT-ASEN-HLRHCLSCS---K-CRKEMGQVEISSCT-VDRDTVC
TNFR1-3_2     CRKN--Q-YR-HYWSENLFQCFNCS---L-CLN--GTV-HLSCQ-EKQNTVC
TNFR1-4_2     CHAG--F-FL-RE-----NECVSCS---N-CKK--S---------LECTKLC
TNFR14-1_1    CKED--E-YP-VG-------SECCP---K-CSP--GYRVKEACG-ELTGTVC
TNFR14-2_2    CPPG--T-YI-AHLN-GLSKCLQCQ---M-CDPAMGLRASRNCS-RTENAVC
TNFR13C-1_3   CVPA--E-CF-DLL---VRHCVACG---L-LRTPRPKP-------------A
TNFR16-1_1    CSTG--L-YT-HS----GEC---CK---A-CNL--GEGVAQPCG-A-NQTVC
TNFR16-2_2    CLDN--VTFS-DVVS-ATEPCKPCT---E-CLG--LQSMSAPCV-EADDAVC
TNFR16-3_2    CAYG--Y-YQ-DE---ETGHCEACS---V-CEV--GSGLVFSCQ-DKQNTVC
TNFR16-4_2    CPEG--T-YS-DEAN-HVDPCLPCT---V-CED--TERQLRECT-PWADAEC
TNFR13B-2_3   CRKEQGK-FY-DH---LLRDCISCA--SI-CGQ--H-------P-KQCAYFC
TNFR17-1_3    CSQN--E-YF-DSL---LHACIPCQ---LRCSSNTPPL---TC-----QRYC
TNFR4-1_1     CVGD--T-YP-SND----R---CCH---E-CRPGN--GMVSRCS-RSQNTVC
TNFR4-2_2     CGPG--F-YN-DVV--SSKPCKPCT---W-CNLRSGSERKQLCT-ATQDTVC
TNFR4-4_2     CPPG--H-FS-PGD---NQACKPW---TN-CTLA-GKHTLQPAS-NSSDAIC
TNFR12-1_3    CSRG--S-SW-SAD---LDKCMDCA---S-CRARPHSD---FC------LGC
TNFR2-1_1     CRLR--E-YY-DQT---A--QMCCS---K-CSP--GQHAKVFCT-KTSDTVC
TNFR2-2_2     CEDS--T-YT-QLWN-WVPECLSCG--SR-CSS--DQVETQACT-REQNRIC
TNFR2-3_2     CRPG--W-YC-ALS--KQEGCRLCAPLRK-CRP--GFGVARPGT-ETSDVVC
TNFR2-4_2     CAPG--T-FS-NTTS-STDICRPHQ---I-CNV-----VAIPGN-ASMDAVC

cons          *                                                  .